下丘脑至垂体至卵巢性腺轴一直以来都控制着内分泌的激素分泌量，而正常的黄体机能也依赖这个系统来维持。但是当性腺轴其中某个环节出现问题时，就会造成黄体功能障碍，导致内分泌失调甚至是不孕的发生。而目前医学界普遍认为黄体功能不全的病因如下：

　　1、在排卵期的时候，促黄体生成素在峰值期不够充足。

　　2、在黄体期间，促黄体生成素分泌不足或者是脉冲式分泌不够充分。

　　3、另外在卵泡期间，促卵泡激素分泌不足。卵泡液里的促卵泡激素和雌二醇低值。

　　值得注意的是，如果子宫内膜出现异常，对黄体分泌的激素无反应或者反应很弱，那么即使黄体自身健康功能健全，也会导致内膜生长不良，出现病症。